博物院这种词颇有古风，源自明清时期对重要机构的称谓，比如考试院，监察院啊等等，1925年故宫收回后怎么处理，颇费思量，后国民政府逢迎民意而准备把故宫对外开放，十分英明，并命名故宫博物院，从命名来看，一是表明对其重视程度（当时最重要的政府部门多数以院称之，二是符合古风称谓，让满清遗老遗少能勉强接受。河南博物院于1927年成立，主要是因为河南当时的盗墓现象太猖獗，市面上文物泛滥，已经到了必须整治的地步，所以整治后归拢文物成立了博物院，命名跟风北京故宫博物院，南京博物院成立于1933年，是国民政府得以相对和平大发展的时候成立的机构，集合归拢了全国许多文物后成立的，文物之多，文物质量之高均是最高水平，所谓南京博物院的称谓带有当时政府高等级机构的意味，与立法院、行政院、考试院、监察院、审计院、法制院等等齐名，带有繁杂和专门事物管理的职能。

再后来，战争时期结束之后，人民政府成立，各省市均得有成立文物专门管理机构的编制，在称呼上出现分歧，这跟当时各省市的最高决策层的文化程度和对文物的重视程度直接相关。在当时称呼馆的多带有为人民服务的气质和诉求，带有院的称呼多带有古代文化称谓以及代表一定的地位级别也可以说代表对文物非常重视。从现在来看，确实是称博物院的相关省市在气势上更足一些，在历史感上更有底蕴一些。

但综合来看，真正满足院级机构设置要求和文物收藏数量和质量符合对等的文物部门只有故宫博物院和南京博物院。故宫博物院对应清政府的国家级收藏，南京博物院对应的是国民政府的国家级收藏。而建国后人民政府未设国家级的收藏机构，把文物分散于各省市进行收集管理。后来的事实证明人民政府的文物管理制度是有重大欠缺的，在破四旧运动中由于文物管理分散导致中央政府的有识之士保护不过来，损失惨重！

我个人认为文物，尤其是重要文物理应国家管理收藏，各省市有展览需求的时候应以借或租用的方式获取重要文物的展览权，并实现有借有还再借不难的风气。文物这种贵重且不可复制复生的物品，经不起战乱和动荡，稍有不慎就是国家和民族、文化历史上的重大损失，以人民的名义行分散管理的方式过于草率和不负责任。

在我国，"博物院″和"博物馆"与行政无关，各级别的"博物馆"都有叫"博物院"的。人们习惯上把"博物院"视为"博物馆"的一个别称。但如果要从潜意识上细加考量，"馆"似乎多强调的是建筑布局，"院″好像多注重的是整齐环境(感觉上级别能高点)。

据中商情报网报:随着我国博物馆(院)事业的发展，博物馆(院)数量不断增加。2016年中国共有博物馆(院)3060个。功能包含了搜集、整理、保存、修复、研究、展览、教育、娱乐等多项内容。形态上包含建筑物,植物园,动物园,水族馆,户外史迹,古城小镇博物馆化,长期仿古生活展示(民俗村)等等。另外，我国民办博物馆也成为博物馆体系中一支不可忽视的力量。

至于说我国现在只有三家叫博物院的:北京故宫博物院、河南博物院、南京博物院，此言差矣！

事实上，在我国叫"博物馆″的挺多，而称"博物院"的较少。本人知道叫"博物院"的有:

北京故宫博物院

台北故宫博物院

南京博物院

河南博物院

山西博物院

内蒙古博物院

西安博物院

河北博物院

四川博物院

秦始皇陵博物院

宝鸡青铜器博物院

我国还有哪些博物院，请大家写在评论里。